Ein NicheFormer ist ein KI-System, das mit Zellprobeninformationen von Mensch und Maus trainiert wurde, um räumliche Muster in Geweben vorherzusagen.⁽¹⁾ Foundation-Modelle sind ein neues Paradigma in der Entwicklung von KI-Systemen. Bisher wurde KI auf aufgabenspezifische Daten trainiert, um eine begrenzte Anzahl von Funktionen auszuführen. Ein Foundation-Modell ist dagegen ein groß angelegtes maschinelles Lernmodell, das auf einem breiten Datensatz trainiert wird und für eine Vielzahl von Anwendungen und nachgelagerten Aufgaben angepasst und verfeinert werden kann.⁽²⁾ 

Trainiert wurde das Foundation-Modell in diesem Fall mit Informationen von mehr als 110 Millionen Zellen und eröffnet einen neuen Ansatz, um zu untersuchen, wie Zellen im Gewebe organisiert sind und miteinander interagieren – ein Wissen, das für das Verständnis von Gesundheit und Krankheit entscheidend ist. 

Sicher sind die Informationen auch die die in vitro-Forschung und -entwicklung interessant.

Originalpublikation:
Tejada-Lapuerta A, Schaar AC, Gutgesell R, Palla G, Halle L, Minaeva M, Vornholz L, Dony L, Drummer F, Richter T, Bahrami M, Theis FJ. Nicheformer: a foundation model for single-cell and spatial omics. Nat Methods. 2025 Oct 30. Epub ahead of print. PMID: 41168487. DOI: 10.1038/s41592-025-02814-z.

Hier geht es zur Pressemitteilung:
https://www.helmholtz-munich.de/newsroom/news/artikel/neues-foundation-modell-zeigt-organisation-von-zellen-im-gewebe

Weitere Informationen:
(1) Helmholtz 1995-2025 (2025). Virtual Cell. Ein digitaler Zwilling für die Medizin von morgen. https://www.helmholtz.de/newsroom/artikel/ein-digitaler-zwilling-fuer-die-medizin-von-morgen/
(2) Lutkevich, B, ComputerWeekly.de (2025). Was sind Foundation Models und wie funktionieren die Modelle? 14. Februar 2025. https://www.computerweekly.com/de/antwort/Was-sind-Foundation-Models-und-wie-funktionieren-die-Modelle